바야흐로 '바이오의 시대'다. 2019년 말에 발생한 COVID-19는 전 세계를 강타했으며, 전염성이 강한 바이러스의 특성으로 인해 속수무책으로 감염자가 증가했다. 팬데믹(pandemic)이 돼버린 시대에 세계의 과학자들은 2003년 인간 게놈 프로젝트가 완료된 이후 탄탄하게 쌓아왔던 생명정보학 기술력을 바탕으로 앞다퉈서 바이러스의 전적 비밀을 밝혀내고 있다. 이러한 생명정보학 분석 기술의 원천이 되는 것이 바로 알고리즘이다.
이 책은 기본적인 파이썬 문법과 분자 생물학의 기초를 소개하는 것으로 시작해 단순한 서열을 다루는 알고리즘에서 그래프 알고리즘과 같은 고급 알고리즘까지 다룬다. 각 장마다 친절히 파이썬 스크립트를 제시할 뿐 아니라 깨알 같은 연습 문제로 알고리즘을 학습할 수 있게 해주는 점은 이 책의 큰 장점이다. 특히 각 장의 내용에 맞게 바이오 파이썬 라이브러리를 활용해 알고리즘을 설명했다는 점도 흥미롭다. 이 책이 생명정보학을 더 깊게 이해하고자 하는 독자들에게 도움이 되길 바란다.
2019년 전 세계를 휩쓴 COVID-19 대유행에 인류는 유래 없이 빠른 속도로 개발된 mRNA 기반 백신으로 바이러스를 정복하고 일상생활로 나아가고 있다. 전 인류가 힘을 모아 숨가쁘게 백신과 치료제를 개발하고 팬데믹 상황을 극복하는 기반에는 지금껏 쌓아 온 생물학과 생물정보학 지식이 있었다. 인간 유전체 프로젝트 이후로 인류는 생명체의 분자 생물학적 비밀을 염기서열 단위로 좁혀서 탐구하고 있다. 이러한 생물정보학 분석의 기초가 되는 것은 바로 알고리듬이다.
이 책은 각 장마다 재미난 그림과 줄거리를 생물정보학의 이야기로 풀어 나가며 독자를 사로잡는다. 이 책의 장점이라고 할 수 있는 것은 생물정보학 알고리듬이 의사 코드의 형태로 제공된다. 의사 코드를 보고 자신에게 익숙한 프로그래밍 언어로 학습한 내용을 구현하며 생물정보학 알고리듬을 학습할 수 있다. 또한 이 책의 가장 큰 장점이라고 할 수 있는 점은 웹사이트 rosalind.info 플랫폼에서 자신이 구현한 프로그램을 업로드하고 정답을 맞혀 순위를 매겨 마치 게임처럼 즐겁고 재밌게 프로그래밍 능력과 생물정보학 알고리듬 지식을 쌓을 수 있다. 생물정보학 실력을 키우고 싶은 독자들에게 강력히 추천한다.
이 책에 관심을 갖고 찾아준 독자분들께 감사의 말씀을 드리며 부디 이 책이 여러분들의 생물정보학 지식과 알고리듬적 사고 향상에 도움이 될 수 있기를 기원한다.
공동역자 한주현
